Инструкция по созданию полностью зашифрованного образа гостевой системы, в котором шифрование охватывает корневой раздел и стадию загрузки.Извлекаем содержимое корневого раздела образа виртуальной машины, который требуется зашифровать,  в tar-архив vm_root.tar. Проверяем, чтобы в образе были необходимые для шифрования и EFI-загрузки разделов утилиты, такие как  cryptodisk и grub-efi. 
Создаём файл с дисковым образом, содержащим два раздела - небольшой раздел для EFI (p1, 100МБ)  и корневой раздел, содержимое которого будет зашифровано (p2).
   truncate -s 4GB disk.img
   parted disk.img mklabel gpt
   parted disk.img mkpart primary 1Mib 100Mib
   parted disk.img mkpart primary 100Mib 100%
   parted disk.img set 1 esp on
   parted disk.img set 1 boot on
Настраиваем EFI на первом разделе и дисковое шифрование LUKS на втором. Для повышения защищённости можно заполнить шифрованный раздел случайными числами, но это приведёт к увеличению размера итогового образа qcow2. Создаём на шифрованном разделе ФС Ext4.
привязываем образ к loop-устройству
   losetup -P -f disk.img          
определяем имя созданного устройства (/dev/loopN), в дальнейшем используем переменную $l вместо устройства
   l=($(losetup -l|grep disk.img)) 
создаём раздел с EFI, используем VFAT
   mkfs.vfat ${l}p1
определяем UUID раздела EFI
   blkid ${l}p1  
создаём шифрованный раздел, в процессе задаём временный пароль для расшифровки
   cryptsetup --type luks1 luksFormat ${l}p2 
определяем UUID шифрованного раздела
   blkid ${l}p2 
активируем шифрованный раздел и создаём на нём ФС ext4
   cryptsetup luksOpen ${l}p2 cr_root
   mkfs.ext4 /dev/mapper/cr_root
монтируем раздел, копируем в него содержимое tar-архива с начинкой корневого раздела и создаём каталоги для точек монтирования /run, /sys, /proc и /dev.
   mount /dev/mapper/cr_root /mnt
   tar -C /mnt -xpf vm_root.tar
   for m in run sys proc dev; do mount --bind /$m /mnt/$m; done
входим в окружение созданного корневого раздела
   chroot /mnt
В /etc/fstab определяем метку корневого раздела (/dev/disk/cr_root) и раздела  EFI (/boot/efi).
Настраиваем и устанавливаем загрузчик GRUB (в некоторых дистрибутивах вместо /boot/grub используется /boot/grub2, а вместо префикса "grub" - "grub2-"):
  echo "GRUB_ENABLE_CRYPTODISK=y" >> /etc/default/grub
   mount /boot/efi
   grub-install --removable --target=x86_64-efi
   grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg
Для систем с mkinitramfs (Debian) дополнительно нужно добавить параметры шифрованного раздела в /etc/crypttab:
   cr_root UUID=<uuid> luks none
После чего пересоздаём образ ram-диска с компонентами для начальной загрузки. 
Для систем с dracut требуется изменить настройки /etc/default/grub, указав в  GRUB_CMDLINE_LINUX привязку rd.luks.uuid=<UUID>. Для дистрибутивов с SELinux также нужно [[https://wiki.centos.org/HowTos/SELinux обновить метки]] (relabel).
Отмонтируем созданные в процессе подготовки образа разделы из /mnt и пытаемся загрузить образ, используя режим EFI. В процессе загрузки вводим заданный ранее временный пароль и проверяем работоспособность окружения.
Заменяем временный пароль на ключ для быстрой загрузки и настраиваем ram-диск для его использования. Для образа, примонтированного через /dev/sda:
   dd if=/dev/urandom bs=1 count=33|base64 -w 0 > /etc/cryptsetup-keys.d/luks-<UUID>.key
   chmod 600 /etc/cryptsetup-keys.d/luks-<UUID>.key
   cryptsetup --key-slot 1 luksAddKey /dev/sda2 # первичный ключ для восстановления
   cryptsetup --key-slot 0 luksRemoveKey /dev/sda2 # удаляем временный ключ
   cryptsetup --key-slot 0 --iter-time 1 luksAddKey /dev/sda2 /etc/cryptsetup-keys.d/luks-<UUID>.key
Указание опции "-w 0" в dd необходимо для того, чтобы исключить появление в пароле символа перевода строки.
Для систем с mkinitramfs теперь нужно изменить настройки /etc/crypttab, указав путь к сгенерированному ключу:
   cr_root UUID=<UUID> /etc/cryptsetup-keys.d/luks-<UUID>.key luks
Для систем с dracut необходимо добавить hook ключа в /etc/dracut.conf.d, а для Debian также потребуется указать маску определения файла с ключом:
cryptodisk.conf 
   install_items+=" /etc/cryptsetup-keys.d/* "
   echo "KEYFILE_PATTERN=\"/etc/cryptsetup-keys.d/*\"" >>/etc/cryptsetup-initramfs/conf-hook
Теперь можно перегенерировать образ RAM-диска начальной загрузки. После попытки загрузки пароль будет спрошен один раз только на стадии запуска GRUB и на последующих стадиях загрузки запрашиваться не будет. 
URL: https://blog.hansenpartnership.com/building-encrypted-images.../
Обсуждается: http://www.opennet.dev/tips/info/3169.shtml