> filtergroupslist = '/etc/dansguardian/lists/filtergroupslist'
> bannediplist = '/etc/dansguardian/lists/bannediplist'
> exceptioniplist = '/etc/dansguardian/lists/exceptioniplist'

смотрите тут на разницу на что имеете сейчас в действительности

> Но эти сайты спокойно открываются (до смены провайдера и изменения dns не
> открывались).
> В /var/log/squid3/access.log эти сайты не попадают
> Подскажите, пожалуйста, куда дальше копать?

значит клиенты выходят мимо Squid прокси