> Здравствуйте, уважаемые любители *nix систем.
> Есть сеть, некоторым пользователям которой нужно иметь возможность работать с сайтом www.ach.gov.ru
> Доступ к интернету осуществляется через прокси-сервер Squid 3.x

Может фигней страдают - блокируют доступ через прокси.
Если есть где потестировать - удалите на сквиде заголовки, позволяющие определить использование прокси (via и т.п.).