День добрый!

Транспорт можно вставлять в любое место секции "begin transports". Порядок их описания не имеет значения, т.к. транспорты срабатывают только при вызове по их имени (в моем случае - "remote_smtp") из роутеров. А вот порядок следования роутеров значение имеет.

Для примера, самый первый роутер:
begin routers
dns_lookup:
  driver = dnslookup
  domains = !+local_domains   # для локальной доставки используется другой роутер
  rewrite_headers = false
  transport = remote_smtp     # вызов транспорта с именем "remote_smtp"
  ignore_target_hosts = 0.0.0.0 : 127.0.0.0/8
  no_more