>ждет I/O

Я об этом подумал, потому что было похоже на какой-то свопинг, но это изначально ссд и зависания на одних и тех же местах в данных, перемещение в tmpfs не помогло, а данные могли быть и другими с тем же результатом. При этом, рядом лежал более сложный код на другом языке (плюсы не идентичны ржавчине, конечно, но операции примерно одинаковы) и на тех же данных у него проблем не возникало.