The OpenNET Project / Index page

[ новости /+++ | форум | теги | ]



"Правка header в fasta"
Версия для распечатки Пред. тема | След. тема
Форум Программирование под UNIX
Исходное сообщение [ Отслеживать ]

. "Правка header в fasta" +/
Сообщение от labradorka2112 (ok), 12-Авг-23, 15:13 
>[оверквотинг удален]
>          3) Могут быть
> в порядке возрастания
>          3) нужна проверка
> вхождения, т.е. что каждый из полученных идентификаторов уникален.
>          4) решить на
> bash, можно и python
> Что нашел: если вместо 0000 тупо клеить какие-нибудь числа, с учетом количества
> строк,очевидно, возникают повторы.
> Рассматриваю sed, rev, tac, seq, grep, uniq
> Из любопытного, но пока не разобрался : cut -d'' -f1|sort|uniq-c|grep -Ev'^[[:space:]]+1[[:space:]]'

Написал говнокод генератора для подстановки в строки, но мне нужны 6-ти значные числа, а тут цифры только 1-9 судя по первой странице.

import random

f = open('randlist.txt', "w")
S = ""
D = (random.sample(range(321456, 879456), k=5675))
for i in D:
    S = S + str(i)
f.write('\n'. join(S))
f.close()

Ответить | Правка | Наверх | Cообщить модератору

Оглавление
Правка header в fasta, labradorka2112, 12-Авг-23, 12:22  [смотреть все]
  • gt оверквотинг удален Написал говнокод генератора для подстановки в строки, но , labradorka2112, 12-Авг-23, 15:13  (1)
Форумы | Темы | Пред. тема | След. тема



Партнёры:
PostgresPro
Inferno Solutions
Hosting by Hoster.ru
Хостинг:

Закладки на сайте
Проследить за страницей
Created 1996-2024 by Maxim Chirkov
Добавить, Поддержать, Вебмастеру