>Чисто EXT4'й прикол.

Но я уже несколько раз писал,разработчики костыль сделали чтобы это дело поправить.
sudo fsck.ext4 -fD

Где D optimize_extens.
Принудительно перестраивает таблицу экстентов когда из за риска потери информации это не делает фс, а дальше освободив экстенты,проверяется иноды и тоже чистятся. ( Это дело можно поправить на новых ядрах, но переписывать старый код multiblock allacator побоялись)