Насколько я понимаю у линукса все же кернел и все что касается сисколов в свежих ядрах очень сильно оптимизировали. Может в этом дело. Это были относительно резвые штуки, на USB3 интерфейсе. Но даже так оно довольно долго в таких объемах пашет.

Если б линь тупил я знаю как там профайлить, но как профайлить тупняки в винде я без малейшего понятия, скажем честно. Там подобная системная активность - рокетсайнс, дебагинфо на драйвер фс для читаемых функций 1 фиг нету, и если в лине я получу картину грабель 1 несчастным "perf top" скорее всего, поимев весьма конкретную разблюдовку по функциям, с всеми причастными в топе (в случае FUSE я и так знаю кто там главный якорь, так что это лишнее), то как такой view вообще в винде получить - да хрен бы его знает. А даже если и узнать, куда потом эти знания? В спортлото? Винда крайне враждебна к системщикам. Поэтому я лучше при оказии линукскернел попрофайлю, имхо. Благо я знаю где там тематические тела отвисают, они интересные наблюдения такого плана ценят.