возможно вы не полностью поняли вопрос. все работает, да, но ситуация осложнена расположением архивируемых папок. Добавить параметр SmbShareName вида Folder1/0001 не удалось, работать такой скрипт не стал - NT_STATUS_BAD_NETWORK_NAME (хотя это было бы идеальным решением). Поэтому я поступил следующим образом:

к примеру создал два хоста с именами server и server01 (по сути это один хост, но дебиан обращается к нему под обоими именами посреством чтения файла /etc/hosts)
для первого сервера параметр
$smbClientPath \\$host\$shareName -D 0001 $I_option -U $userName -E -d 1 -c tarmode\ full -Tc$X_option - $fileList

а для второго
$smbClientPath \\$host\$shareName -D АААА $I_option -U $userName -E -d 1 -c tarmode\ full -Tc$X_option - $fileList

таким образом smbclient входит в папки 0001 и АААА и копирует инфу оттуда, не копируя всю шару.