> Пока код ещё похож на обычный С, те без классов, темплейтов, лямд и проечей фигни это норм, и реально быстрее писать.

Без классов и шаблонов... так в них же как раз вся соль!

> Но классы, наследование, темплейты и прочая тарабарщина начинают резко усложнять структуру кода, размазывая простую и очевидную в С логику тонким слоем по десяткам файлов/классов.

В этом случае вопросы не к языку, а к человеку, который отвечает за архитектуру программы. Язык программирования только предоставляет возможности, а уж как их использовать решает программист. Я тоже такое не очень люблю, когда размазывают код по сотням мелких файлов без реальной на то необходимости. Но язык здесь ни при чём.

> Там где я в С делаю какую то отдельную функцию крестовики обычно пихают это в класс...

Крестовики могут делать ровно то же самое, что и ты, поверь. По сути, твои программы на С являются корректными программами на С++.

> Для меня рефакторинг это пройти по всем вхождениям функции в коде и добавить/убрать аргумент, а для крестов там могут найтись дальние наследники и замучишься править.

Во-первых, в С++ придётся делать то же самое ("пройти по всем вхождениям функции в коде и добавить/убрать аргумент"). Во-вторых, если хочется дополнительно ещё и классы с наследованием (а такое в реальности встречается нечасто), то да, в этом случае придётся приложить какие-то дополнительные усилия. Ну так и классы с наследованием используются не просто так на ровном месте, а только при реальной необходимости, и они предоставляют определённые возможности, удобство, сервис.

> ... пару раз и чистил авгеевы конюшни класса-в-классе-в-классе-в-классе-...в цикле... ради одного примитивного действия

В данном случае вопросы не к языку программирования, а к программисту, т.к. он отвечает за архитектуру программы.